Die häufigsten Nebenwirkungen der Einnahme eines Aromatasehemmers sind Gelenkschmerzen, Schwäche, Müdigkeit, Stimmungsschwankungen, Depressionen, Bluthochdruck, Schwellungen der Hände/Füße und Kopfschmerzen. 

Ein Aromatasehemmer kann auch den Grad der Knochenmineralisierung verringern, was zu Osteoporose führen und das Risiko von Frakturen bei anfälligen Patienten erhöhen kann. Manche Menschen können auf Medikamente mit Magen-Darm-Beschwerden reagieren, einschließlich Übelkeit und Erbrechen.

Letrozol können einem ungeborenen Fötus schaden und sollten während der Schwangerschaft nicht begonnen werden. Wenn ein Aromatasehemmer von Männern verwendet wird, um die Auswirkungen von Östrogenen auf die langfristige Einnahme von Steroiden zu reduzieren, kann er das Risiko von Herz-Kreislauf-Erkrankungen erhöhen, indem er einige der vorteilhaften Wirkungen von Östrogen auf das Cholesterinvolumen verringert.

Studien haben gezeigt, dass die Unterdrückung von HDL (gutem) Cholesterin signifikant ist, wenn ein Aromatasehemmer in Verbindung mit Testosteron Enanthate verwendet wird. Da Tamoxifen keine so negative Wirkung auf den Cholesterinspiegel hat, sollte es daher von Männern bevorzugt werden, die anfällig für Herz-Kreislauf-Erkrankungen sind.